海水熱源利用的船用空調控制系統由海水回路、制冷劑回路、熱回收回路及電控箱組成，通過工作模式的轉換，實現夏季制冷、冬季制熱。
   控制方法是當船舶航行時，充分利用船舶排至環境的余熱預熱低溫海水；當船舶錨泊時，利用燃油鍋爐預熱低溫海水，實現船用海水源熱泵空調系統在低溫海域或錨泊時正常或高效運行。
   海水熱源利用的船用空調不但解決了常規船用海水源熱泵空調系統不能全天候，全海域運行的技術屏障，同時通過有效回收利用船舶排至環境的余熱，進一步提高船舶能量的利用率，實現低能耗，低排放和高能效的船舶空調系統。